Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col5a3Q9JLI2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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