Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gde1Q9JL56 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gde1Q9JL56 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gde1Q9JL56 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Gde1Q9JL56 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms