Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Habp4Q9JKS5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms