Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Scamp5Q9JKD3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms