Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1Q9JIT0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms