Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccl28Q9JIL2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccl28Q9JIL2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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