Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
OtofQ9ESF1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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