Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Capn12Q9ER56 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Capn12Q9ER56 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn12Q9ER56 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms