Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trmt112Q9DCG9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt112Q9DCG9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms