Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf6Q9DBU5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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