Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SrpraQ9DBG7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms