Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms