Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd9Q9D9M4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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