Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Snx5Q9D8U8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms