Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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