Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms