Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms