Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms