Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syce1Q9D495 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms