Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx29Q9D3S3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx29Q9D3S3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms