Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stag1Q9D3E6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stag1Q9D3E6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms