Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx20Q9D2Y5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms