Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramef12Q9D2F1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms