Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Trappc6bQ9D289 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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