Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc47Q9D024 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms