Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Exo5Q9CXP9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Exo5Q9CXP9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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