Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CXL3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms