Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NubplQ9CWD8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms