Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcf1Q9CTH6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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