Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snw1Q9CSN1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snw1Q9CSN1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms