Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim8Q9CQQ0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms