Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccer1Q9CQL2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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