Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms