Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med4Q9CQA5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med4Q9CQA5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms