Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp2Q9CQ73 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms