Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Use1Q9CQ56 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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