Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg3Q9CPX6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms