Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms