Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp1b4Q99ME6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms