Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gps1Q99LD4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms