Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubxn2aQ99KJ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms