Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim11aQ99J19 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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