Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms