Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Traf7Q922B6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms