Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms