Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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