Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Hoxc12Q8K5B8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc12Q8K5B8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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