Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MyripQ8K3I4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms