Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ssh3Q8K330 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms