Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd3Q8K2F0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms